10.09.2015
Offener Katalog für MALDI-TOF-Daten
Die MALDI-TOF-Massenspektrometrie (MALDI-TOF MS) zeigt in Forschungs- und Routinelaboratorien eine rasant steigende Verbreitung. Die Geräte kombinieren dabei eine Matrix-unterstützte Laser Desorption/Ionisation (MALDI) mit einem Flugzeitanalysator (time of flight, TOF) zur Massenspektrometrie (MS). Hiermit können große Biopolymere, wie beispielsweise Proteine aus Mikroorganismen, Fisch oder Fleisch relativ schonend analysiert werden.
Die Technik wird dabei bisher insbesondere zur Differenzierung von Bakterien und anderen Mikroorganismen in der klinischen Mikrobiologie, der veterinärmedizinischen Diagnostik oder der Lebensmittelmikrobiologie eingesetzt. Die Identifizierung eines unbekannten Mikroorganismus gelingt hier durch Vergleich des erhaltenen Massenspektrums mit den in einer Datenbank hinterlegten Referenzen. Diese Datenbank ist für die Identifizierung von zentraler Bedeutung.
Die von den meisten Anwendern eingesetzten Systeme aus Gerät und Software lassen neben dem Einsatz der umfangreichen Hersteller-Datenbanken auch eigene Einträge zu. Diese sind innerhalb einer Geräteplattform übertragbar. Somit können durch eigene Datenbankeinträge diagnostische Lücken schneller geschlossen werden. Dies gilt aus unserer Erfahrung insbesondere für eine Reihe spezieller Mikroorganismen aus der veterinärmedizinischen Mikrobiologie. Für andere Untersuchungsgebiete, wie beispielsweise die Unterscheidung von Tierarten per MALDI-TOF MS, werden bisher kaum Datenbanken angeboten, obwohl diese einen weiten Anwenderkreis interessieren.
Um Angaben über vorhandene, qualitativ hochwertige Datenbankeinträge von Anwendern für Anwender zur Verfügung zu stellen, hat das Chemische und Veterinäruntersuchungsamt einen "offenen Katalog" im Internet veröffentlicht. Der Katalog wird im Rahmen der Internetpräsenz "UA-BW" auf einer Subdomain gepflegt und in festen Abständen aktualisiert.
Quelle: Chemisches und Veterinäruntersuchungsamt Stuttgart