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Nachrichten und Pressemeldungen aus Labor und Analytik

01.02.2008

Applied Biosystems und Integromics schaffen integrierte Plattform für Real-Time-PCR und Datenanalyse


Applied Biosystems und Integromics S. L. haben die Markteinführung eines integrierten Analysesystems für Real-Time-PCR-Daten bekanntgegeben. Dazu haben die Firmen eine einzigartige Lösung geschaffen, die aus einer integrierten, hoch entwickelten Bioinformatik-Software besteht, die mit Hochdurchsatz-Real-Time-PCR-Geräten verknüpft ist. Diese Plattform soll Biowissenschaftlern bei der Datenanalyse in unterschiedlichen Forschungsprojekten helfen.

Die neue Entwicklung verknüpft die Real-Time StatMinerTM Software von Integromics mit einem beliebigen Real-Time-PCR-System von Applied Biosystems. Die gemeinschaftliche Entwicklung wird von beiden Unternehmen vermarktet.

Real-Time-PCR ist eine gängige Labormethode zum qualitativen und quantitativen Nachweis von Nukleinsäuren. Die gewonnenen Daten können Biowissenschaftlern helfen, Variationen in der Genexpression zu beurteilen. Das Verfahren wird häufig eingesetzt, um die Entstehung bestimmter Krankheiten, die Differenzierung von Stammzellen oder die Toxizität von Wirkstoffen zu bestimmen. Auch zur Untersuchung von miRNAs, eine eher junges Forschungsgebiet, werden häufig Real-Time-PCR-Experimente durchgeführt. Mit ihrer Hilfe können Wissenschaftler die Rolle genetischer Marker bei der Klassifizierung von Krankheiten und bei der Suche nach neuen Wirkstoffen besser erforschen.

Weil die Zahl der Real-Time-PCR-Anwendungen stetig steigt, bedarf es integrierter Hochdurchsatz-Datenanalysetools, die lückenlos mit den Geräten zusammenarbeiten. Dafür entwickeln Forscher oftmals ihre eigenen Software-Programme, die jedoch nur unzureichend in die Gerätesysteme integriert sind. Das hat zur Folge, dass meist nur Anwender mit großer bioinformatischer Erfahrung die Systeme bedienen können. Die Lösung von Applied Biosystems und Integromics verknüpft das Gerät, das die Daten produziert, mit der Software zur Analyse dieser Daten.

Zunächst werden die Rohdaten von dem Real-Time-PCR-Gerät von Applied Biosystems erfasst. Mit der StatMiner Software werden die Daten, die während des PCR-Prozesses generiert worden sind, dann visualisiert und analysiert. Dazu dienen verschiedene interaktive Datenvisualisierungs-Werkzeuge und verschiedene statistische Analyse- und Data Mining-Tools. Der Anwender wird durch den gesamten Analyseprozess geführt. Somit ist es auch Laien auf dem Gebiet der Bioinformatik möglich, die Datenanalyse durchzuführen.

"Fortschrittliche Bioinformatik-Tools, die Forschern bei der Analyse und Interpretation von Rohdaten aus Genexpressionsstudien helfen, werden als Ergänzung zu den modernen Geräten und Reagenzien immer wichtiger", so Vicente R. Carro, Chief Executive Officer von Integromics SL. "Indem wir die führenden Real-Time-PCR-Systeme von Applied Biosystems mit der Expertise von Integromics auf dem Gebiet der Bioinformatik kombinieren, bieten wir unseren Kunden eine bessere Möglichkeit, ihre Hochdurchsatzprojekte zu organisieren und ihre Real-Time-PCR-Daten zu analysieren."

Integromics entwickelt moderne Software-Tools für das Data Management, die Integration und die Datenanalyse in der Genom- und Proteomforschung. Die Real-Time StatMiner Software von Integromics ist eine Stand-Alone-Applikation, die auch als integrierter Guide innerhalb anderer führender Labordaten-Analysesysteme erhältlich ist.

Quelle: Applied Biosystems




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